教育部於95年度成立群科中心，並於當年度開始運作。
95年度完成組織編制、網站建置、發行電子報及辦理相關研習活動等重點工作。
在96年度各課程發展中心將其工作移轉至群科中心學校後，其地位及工作更加顯得重要。
96年度因行政運作更換部分群科中心學校，各中心亦辦理諸多相關活動，如：教師研習、協助課綱修訂、發展教材…等工作，在課程暫綱之推動及群科課綱之修訂上均發揮極大之功能。
各群科中心學校亦於97、98及99年度在技術型高中課綱之推動扮演十分重要的角色，尤其於99年度課綱正式實施，承接全國技術型高中學生100及101年度專題製作競賽複賽之辦理、部定課綱新增單元、教師知能研習、課綱及考科意見的彙整與陳轉等活動。
101年度工作圈又因應十二年國民基本教育之實施，面對家長多元的升學需求，更為強化綜合高中的課程推動，教育部國民及學前教育署設立綜合高中中心，以利落實綜合高中在選修機制、職涯試探、學術學程專題製作等非群科中心學校所及之課程領導機制，強化綜合高中的課程分流優勢。

群科中心主要工作項目：「配合課程研發單位及工作圈，執行課程綱要研修及協作相關工作，蒐集高級中等學校教學實務興革建議」、「建置群科諮詢輔導機制，成立種子教師社群，並協助各區域學校推動教師專業社群及教師課程共備機制」、「研發並彙整教材教法、教學與評量及課程綱要所定議題融入課程教案等示例，作為相關教學資源」、「精進教師教學效能，依群科特色及教學現場需求，辦理全國或跨直轄市、縣（市）區域型式之教師專業研習，並推動跨領域、跨學科之專題類或統整類課程、活動或競賽」、「充實及活化群科中心資訊平臺，定期發行電子刊物」、「協助國教署與工作圈辦理高級中等學校課程推動事務及其他交辦事項」及「中心特色工作自發性課程推動」，運作至今已累積多年經驗，且執行成效良好，使課程推動措施得以順利運作。